Durant ces deux dernières années, Jak a été le cobaye de nombreuses expériences liées au projet "Dark Warrior" du Baron Praxis, le dirigeant de la ville. br Jak s'est vu injecter des doses normalement mortelles d'Eco Noire, et lorsqu'il est finalement sauvé par Daxter, il n'est plus le même, et il est avide de vengeance. br La première étape consiste simplement à s'évader de la Forteresse.