Antimario s'est reconverti en trafiquant de Yoshis, et Mario doit parvenir à le faire fuir pour sauver Yoshi. br Celui-ci va lui permettre de se débarrasser de l'ananas qui bouche l'entrée de la Plage Sirena, où Mega Manta, une silhouette de raie manta géante, a répandu une matière électrique qui a englouti l'Hôtel Delfino, et de plus, il se divise en petits mantas lorsqu'il est arrosé.