Un adolescent découvre, dans une grotte du Texas, des ossements préhistoriques. A leur contact, son organisme est envahi par un mystérieux parasite. Son corps est emmené avant l'arrivée des secours par un individu étrange...Parallèlement à Dallas, les agents du FBI, Dana Scully et Fox Mulder, tentent de désamorcer une bombe dans un immeuble fédéral !Ils apprennent par la suite que l'explosion a un rapport avec un chantier d'expérimentations situé au Texas.