В годы войны Сергей Михайлович Федосеев непосредственно участвовал в операциях по захвату немецких агентов-парашютистов и в радиоиграх с Абвером. В июне 1953 года, назначен Берией резидентом в СФРЮ, однако из-за хрущевского переворота командировка не состоялась. Был уволен из органов, как проходящий по делу Берии. Впоследствии восстановлен. В 1960 году возглавил вновь созданное подразделение по борьбе с контрабандой и нарушениями валютных операций.