La historia retoma los eventos tras el final de la temporada anterior, cuando una ola masiva de naves nodrizas aparece sobre las principales capitales del mundo. Los protagonistas, ahora dispersos por el planeta, deben afrontar decisiones imposibles mientras intentan unirse para liderar la última resistencia. Aneesha (Golshifteh Farahani), ahora convertida en una figura clave del movimiento rebelde, debe proteger a sus hijos mientras descubre que su conexión con los invasores es mucho más profunda de lo que imaginaba.