Après la cinématique, Link se retrouvera face à Ganondorf. Occupez Ganondorf avant de lui lancer une flèche de lumière pour l'atteindre sans qu'il arrive à l'éviter. Zelda va se faire assommer par Ganondorf. Profitez-en pour effectuer une attaque spéciale consistant à viser votre adversaire puis esquiver son attaque. Link laissera Excalibur dans le crane de Ganondorf qui se transformera en pierre... Et c'est le Roi d'Hyrul qui viendra vous remercier en personne de votre bravoure ainsi que de votre long périple.