Robert H. Eisenman es un arqueólogo estadounidense y erudito bíblico. Es famoso sobre todo por su trabajo polémico sobre los Rollos del Mar Muerto y los orígenes del cristianismo.
Eisenman afirma que los prejuicios del grupo de eruditos que primero descubrieron y trabajaron en las Rollos del Mar Muerto, dirigido por el Padre Roland De Vaux, les hicieron descartar las pruebas que indicaban que muchos de los rollos podrían datar del siglo I, y en cambio les asignaron un pasado más distante.

Considera que los Rollos del Mar Muerto son documentos de inspiración mesiánica, pertenecientes a un partido piadoso, patriótico y ultraconservador judío, opositor al gobierno romano/herodiano en Palestina, cuyos miembros eran conocidos como "zaddikim" o "zadokitas" ("los Justos"), que se reunían principalmente en Qumrán. Eisenman identificó al líder de este movimiento de oposición, conocido como el "Maestro Justo", con Santiago el Menor, hermano de Jesús, ejecutado por orden del Sumo Sacerdote Ananías ben Ananías en 62 E.C. Sostiene además que el renombre de Santiago y la ilegalidad de su muerte pudieron haber accionado la primera de las guerras judeo-romanas contra el Imperio Romano, del 66 al 73 E.C.

Eisenman, como otros eruditos, ha propuesto la tesis de que Santiago el Justo y los zaddikim, conocidos hoy como judíos nazarenos o (judeocristianos), fueron marginados por un herodiano nombrado Pablo de Tarso y los cristianos de origen gentil que le siguían. Esta versión del cristianismo, lidereada por Pablo, transformó la enseñanza militante de los zaddikim a una doctrina universalista y pacífica.
Las tesis de Eisenman han sido criticadas extensamente, por la reconstrucción que hace de los enfrentamientos entre el judeocristianismo y el cristianismo paulino, y por los supuestos elementos "proto-cristianos" que identifica en los Rollos del Mar Muerto. Es áspero en su descripción de los judíos nazarenos de Jerusalén, que él retrata como una secta nacionalista, sacerdotal y xenófoba de pietistas ultra-legalistas. Sus críticas deconstructivas tratan a la doctrina cristiana como principalmente apología paulina. Con esta posición, Eisenman pretende "recuperar" de la oscuridad lo que considera es la enseñanza auténtica de Jesús y Santiago.
Entre otras teorías, Eisenman observa que el testimonio de Josefo sobre la ejecución que ordenó Herodes de dos de sus hijos y su esposa Mariamne, última representante de la línea de los Macabeos, inspiró realmente el relato de la matanza de los inocentes del Evangelio de Mateo (2:16-18), puesto que sus dos hijos eran de sangre judía real, y Herodes creía que eran una amenaza verdadera a su energía.